امام نهم 25 سال بيشتر عمر نكرد. هفت سال و چند ماه با پدر زيست و مدت امامت او هفده سال بود. و مأمون خليفه ي عباسي بسيار به او علاقه داشت و فريفته ي فضل و كمال او در سن كودكي گرديد و كمال عقل، حكمت و ادب امام عليه السلام، مأمون را شيفته ي خود كرده بود به طوري كه احدي از اهل زمان او با امام همطرازي نداشت . و به همين علت و علاقه، مأمون، دختر خود ام الفضل را به ازدواج او در آورد و او را به همراه امام عليه السلام به مدينه گسيل داشت. [1] و سعي بسيار در تعظيم، تكريم و احترام حضرت داشت.

امامت آن حضرت ، بقيه ي حكومت مأمون بود و سپس به مدت هشت سال و چند ماه در زمان خلافت معتصم عباسي زيست و معتصم، همان خليفه اي است كه شهر سر من راي (سامرا) را بنا نهاد و تركان را وارد دستگاه خلافت نمود . امام در اوايل حكومت معتصم، به شهادت رسيد كه صلوات خدا بر او باد!